我國科學(xué)家成功破譯南美白對(duì)蝦基因組
新華社青島1月24日電(記者張旭東)中國科學(xué)院海洋研究所科研團(tuán)隊(duì)歷時(shí)10年成功破譯凡納濱對(duì)蝦(又稱“南美白對(duì)蝦”)基因組,並獲得高品質(zhì)的對(duì)蝦基因組參考圖譜,研究成果在《自然》雜誌子刊《自然通訊》線上發(fā)表。
中國科學(xué)院海洋研究所研究員相建海介紹,對(duì)蝦基因組是世界上公認(rèn)的高複雜基因組,中國科學(xué)院海洋研究所科研團(tuán)隊(duì)嘗試了從一代到三代的各種基因組測(cè)序平臺(tái)及各種組裝軟體,最終完成了凡納濱對(duì)蝦的全基因組測(cè)序和組裝,並獲得了高品質(zhì)的對(duì)蝦基因組參考圖譜。
通過分析發(fā)現(xiàn),凡納濱對(duì)蝦共有約24億個(gè)鹼基對(duì)。以1-6鹼基為單位多次重復(fù)的簡(jiǎn)單串聯(lián)序列(SSR)佔(zhàn)對(duì)蝦基因組的23.93%以上,是目前已測(cè)基因組物種中含量最高的,這也是對(duì)蝦基因組高複雜性的根本原因。
此外,科研人員在對(duì)蝦基因組上發(fā)現(xiàn)了兩大結(jié)構(gòu)特徵:大量的物種特異性基因和大量的串聯(lián)重復(fù)基因,這可能與對(duì)蝦科的特異性進(jìn)化有密切聯(lián)繫。
中國科學(xué)院海洋研究所研究員李富花表示,對(duì)蝦基因組的破譯,為甲殼動(dòng)物底棲適應(yīng)和蛻皮等研究提供了重要理論基礎(chǔ)和數(shù)據(jù)支撐,同時(shí)也為對(duì)蝦基因組育種和分子改良工作提供了重要基礎(chǔ)平臺(tái)。
據(jù)了解,凡納濱對(duì)蝦作為四大養(yǎng)殖蝦類之首,其全球年産量達(dá)416萬噸,具有非常重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。我國的凡納濱對(duì)蝦産量佔(zhàn)全球的四分之一以上。由於種質(zhì)資源匱乏,我國每年需從國外引進(jìn)大量凡納濱對(duì)蝦苗種。
“凡納濱對(duì)蝦基因組的破譯,將有力促進(jìn)我國對(duì)蝦分子育種和全基因組育種的發(fā)展,産生我國自主培育的凡納濱對(duì)蝦品種,推動(dòng)我國種業(yè)發(fā)展。”李富花説。