臺“最高法院”則指出，收到上訴書之後，因?qū)凫吨卮笊鐣毮堪讣酪?guī)定會優(yōu)先分案審理；至於會不會在“大選”前宣判，要看收案的合議庭態(tài)度。
另據(jù)報道，臺檢方對馬英九特別費(fèi)案提起上訴，還強(qiáng)調(diào)希望讓臺“最高法院”統(tǒng)一見解，有島內(nèi)法官批評這根本就是推責(zé)任；也有檢察官説簡直是自我矮化，已失檢察體系的主體性。
有法官質(zhì)疑，特別費(fèi)性質(zhì)的認(rèn)定如果真有爭議，“法令”規(guī)定不明確，依法利益應(yīng)歸被告，檢方當(dāng)初怎麼會起訴？起訴一再被判無罪後，為何還提上訴？另有法官説，過去從沒聽過檢方內(nèi)部意見不一致，要靠臺“最高法院”來統(tǒng)一見解，提供檢方辦案參考。
也有檢察官認(rèn)為，“天底下沒有檢察官上訴的目的，是要最高法院再為地院（地方法院）、高院背書”。
另一位檢察官認(rèn)為，臺“最高法院”一個庭表示意見後，檢察官就完全接受、臣服，豈不代表檢察官原來的堅持及“法律”確信都是假的？（周先）
附：臺“高檢署”上訴書列舉四項上訴理由：
一、證據(jù)能力問題，“高院”判決認(rèn)為臺當(dāng)局“行政院主計處”、“法務(wù)部”對於特別費(fèi)屬於薪資實(shí)質(zhì)補(bǔ)貼的法律見解，“高檢”認(rèn)為法律見解屬於“傳聞證據(jù)”，沒有證據(jù)能力。
二、“定額統(tǒng)籌概算型費(fèi)用”是“高院”判決書中自創(chuàng)的看法，特別費(fèi)領(lǐng)據(jù)列報就屬於定額統(tǒng)籌概算型費(fèi)用。“高檢”質(zhì)疑，現(xiàn)行預(yù)算、審計、主計、會計“法規(guī)”都沒有這個概念，也沒有“法源”依據(jù)，判決依據(jù)為何？
三、“高院”判決指“領(lǐng)據(jù)特別費(fèi)”的核銷程式多年來已形成行政慣例，並産生“行政習(xí)慣法”的效力。“高檢”反駁，特別費(fèi)到底是薪資實(shí)質(zhì)補(bǔ)貼或一定要因公支用，爭議不斷，並未形成行政慣例。
四、“高院”判決認(rèn)為“領(lǐng)據(jù)特別費(fèi)”是薪資實(shí)質(zhì)補(bǔ)貼，用領(lǐng)據(jù)請領(lǐng)後即視為因公支出，但又非個人所得；或稱已喪失公款性質(zhì)，而屬於具領(lǐng)“首長”所有；或?qū)凫丁笆组L”個人所有，應(yīng)做為公務(wù)上之交際應(yīng)酬犒賞使用。“高檢”認(rèn)為明顯地前後論述不一，互相矛盾。