2001年1月金門、馬祖客船首次直航廈門、福州馬尾港，實現(xiàn)海上客貨直航。

　　1月28日，福州馬尾經(jīng)濟文化合作中心代表與馬祖地區(qū)代表在福州簽署了《福州馬尾-- 馬祖關(guān)於加強民間交流與合作的協(xié)議》。

　　臺灣當局開放金門、馬祖與福建沿海“小三通”。

　　2001年2月 

　　2月6日， 廈門“鼓浪嶼”號客船載著75名居住在廈門的金門籍同胞，從廈門首次直航金門探親。

　　臺灣銀行金門分行由原簡易外匯銀行分行升為功能齊全的外匯指定銀行，自3月1日起辦理各項海外匯款業(yè)務(wù)。

　　2001年3月 

　　廈門市兩岸交流協(xié)會代表與金門地區(qū)兩岸關(guān)係交流協(xié)會代表簽署了《關(guān)於加強廈門與金門民間交流交往合作協(xié)議》。

　　2001年7月 

　　福建省組織了晉江市50家知名企業(yè)、2000多件産品首次赴金門舉辦“晉江市名優(yōu)特産品金門展銷會”，這是祖國大陸産品首次在臺灣地區(qū)展銷。

　　福州馬尾經(jīng)濟交流合作中心組團赴馬祖考察，這是福建船舶首次直航馬祖。

　　臺灣召開“經(jīng)發(fā)會”，在兩岸“三通”方面達成如下共識：

　　(1)配合加入WTO進程，開放兩岸直接貿(mào)易及兩岸直接通郵、通訊等業(yè)務(wù)。

　　(2)整體規(guī)劃兩岸“通航”事宜，並通過兩岸協(xié)商予以落實推動。

　　(3)擴大“境外航運中心”功能及範圍，開放貨品通關(guān)入境。

　　(4)積極評估建立“經(jīng)貿(mào)特區(qū)”。此後，臺灣當局以“積極開放、有效管理”取代“戒急用忍”政策。

　　2001年11月1日 

　　海南三亞飛行責任區(qū)改由大陸空中交通管制部門負責，臺灣5家航空公司的飛機飛行東南亞國家的航班均使用該航路，大陸航管部門為臺灣航空公司提供了安全、優(yōu)質(zhì)、高效的空中交通服務(wù)。

　　臺灣當局開放銀行赴大陸設(shè)立代表處。

　　2001年11月 

　　兩岸先後加入世界貿(mào)易組織(WTO)。

　　臺灣擴大“境外航運中心”功能，允許大陸貨物進入出口加工區(qū)、工業(yè)園區(qū)、科技園區(qū)、保稅區(qū)加工後再出口。